Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lnx1O70263 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lnx1O70263 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lnx1O70263 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lnx1O70263 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lnx1O70263 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lnx1O70263 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lnx1O70263 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lnx1O70263 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lnx1O70263 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Lnx1O70263 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Lnx1O70263 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lnx1O70263 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Lnx1O70263 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lnx1O70263 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lnx1O70263 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lnx1O70263 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lnx1O70263 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lnx1O70263 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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