Protein–RNA interactions for Protein: O55234

Psmb5, Proteasome subunit beta type-5, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb5O55234 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb5O55234 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms