Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cbx4O55187 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cbx4O55187 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cbx4O55187 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cbx4O55187 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cbx4O55187 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cbx4O55187 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cbx4O55187 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cbx4O55187 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cbx4O55187 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cbx4O55187 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cbx4O55187 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cbx4O55187 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cbx4O55187 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cbx4O55187 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cbx4O55187 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cbx4O55187 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cbx4O55187 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cbx4O55187 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cbx4O55187 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cbx4O55187 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cbx4O55187 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cbx4O55187 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cbx4O55187 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cbx4O55187 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cbx4O55187 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cbx4O55187 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cbx4O55187 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cbx4O55187 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cbx4O55187 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cbx4O55187 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cbx4O55187 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cbx4O55187 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cbx4O55187 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cbx4O55187 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cbx4O55187 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cbx4O55187 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cbx4O55187 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.3 ms