Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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