Protein–RNA interactions for Protein: O55135

Eif6, Eukaryotic translation initiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif6O55135 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Eif6O55135 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Eif6O55135 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Eif6O55135 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Eif6O55135 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Eif6O55135 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Eif6O55135 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms