Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PrxO55103 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PrxO55103 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrxO55103 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrxO55103 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrxO55103 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrxO55103 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrxO55103 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrxO55103 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrxO55103 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PrxO55103 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PrxO55103 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PrxO55103 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PrxO55103 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PrxO55103 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PrxO55103 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PrxO55103 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PrxO55103 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PrxO55103 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PrxO55103 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PrxO55103 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PrxO55103 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PrxO55103 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PrxO55103 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PrxO55103 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PrxO55103 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PrxO55103 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PrxO55103 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PrxO55103 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PrxO55103 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PrxO55103 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PrxO55103 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PrxO55103 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PrxO55103 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrxO55103 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrxO55103 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrxO55103 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrxO55103 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrxO55103 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrxO55103 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrxO55103 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrxO55103 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrxO55103 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrxO55103 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrxO55103 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrxO55103 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrxO55103 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrxO55103 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrxO55103 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrxO55103 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrxO55103 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrxO55103 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrxO55103 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrxO55103 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrxO55103 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrxO55103 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrxO55103 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrxO55103 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrxO55103 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrxO55103 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrxO55103 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrxO55103 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrxO55103 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrxO55103 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrxO55103 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrxO55103 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrxO55103 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrxO55103 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrxO55103 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrxO55103 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrxO55103 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrxO55103 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrxO55103 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrxO55103 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrxO55103 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrxO55103 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrxO55103 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PrxO55103 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrxO55103 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PrxO55103 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrxO55103 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrxO55103 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrxO55103 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrxO55103 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrxO55103 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrxO55103 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrxO55103 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrxO55103 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrxO55103 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrxO55103 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrxO55103 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrxO55103 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrxO55103 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrxO55103 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrxO55103 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrxO55103 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrxO55103 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrxO55103 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrxO55103 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrxO55103 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms