Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Copb2O55029 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Copb2O55029 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copb2O55029 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Copb2O55029 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Copb2O55029 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Copb2O55029 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Copb2O55029 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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