Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

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Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek2O35942 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek2O35942 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek2O35942 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek2O35942 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek2O35942 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek2O35942 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek2O35942 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek2O35942 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek2O35942 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms