Protein–RNA interactions for Protein: O35900

Lsm2, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm2O35900 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm2O35900 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm2O35900 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm2O35900 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm2O35900 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm2O35900 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm2O35900 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm2O35900 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm2O35900 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm2O35900 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm2O35900 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm2O35900 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm2O35900 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm2O35900 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm2O35900 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm2O35900 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm2O35900 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm2O35900 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm2O35900 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm2O35900 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm2O35900 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm2O35900 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm2O35900 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm2O35900 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm2O35900 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lsm2O35900 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lsm2O35900 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lsm2O35900 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lsm2O35900 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lsm2O35900 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm2O35900 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms