Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms