Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf5O35445 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms