Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Abcc1O35379 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Abcc1O35379 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Abcc1O35379 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Abcc1O35379 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Abcc1O35379 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Abcc1O35379 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Abcc1O35379 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Abcc1O35379 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Abcc1O35379 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Abcc1O35379 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Abcc1O35379 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Abcc1O35379 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Abcc1O35379 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Abcc1O35379 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms