Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d1bO35324 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d1bO35324 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d1bO35324 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d1bO35324 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d1bO35324 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d1bO35324 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d1bO35324 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d1bO35324 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d1bO35324 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d1bO35324 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d1bO35324 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d1bO35324 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d1bO35324 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d1bO35324 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d1bO35324 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms