Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim18J3QNP2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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