Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm3415J3QMS8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3415J3QMS8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3415J3QMS8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3415J3QMS8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3415J3QMS8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3415J3QMS8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3415J3QMS8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3415J3QMS8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3415J3QMS8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3415J3QMS8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3415J3QMS8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3415J3QMS8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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