Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tubgcp6G5E8P0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms