Protein–RNA interactions for Protein: G3X9N3

Pnmal2, MCG16539, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnmal2G3X9N3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pnmal2G3X9N3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pnmal2G3X9N3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pnmal2G3X9N3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pnmal2G3X9N3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pnmal2G3X9N3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Pnmal2G3X9N3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pnmal2G3X9N3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pnmal2G3X9N3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pnmal2G3X9N3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pnmal2G3X9N3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pnmal2G3X9N3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pnmal2G3X9N3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pnmal2G3X9N3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pnmal2G3X9N3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pnmal2G3X9N3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pnmal2G3X9N3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pnmal2G3X9N3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pnmal2G3X9N3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pnmal2G3X9N3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pnmal2G3X9N3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pnmal2G3X9N3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pnmal2G3X9N3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms