Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc9a3G3X939 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms