Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms