Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ercc6F8VPZ5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms