Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Colca2F8VPY8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Colca2F8VPY8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Colca2F8VPY8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Colca2F8VPY8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Colca2F8VPY8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Colca2F8VPY8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Colca2F8VPY8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Colca2F8VPY8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Colca2F8VPY8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Colca2F8VPY8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Colca2F8VPY8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Colca2F8VPY8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Colca2F8VPY8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Colca2F8VPY8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Colca2F8VPY8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Colca2F8VPY8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Colca2F8VPY8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Colca2F8VPY8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Colca2F8VPY8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Colca2F8VPY8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Colca2F8VPY8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Colca2F8VPY8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Colca2F8VPY8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Colca2F8VPY8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Colca2F8VPY8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Colca2F8VPY8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Colca2F8VPY8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Colca2F8VPY8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Colca2F8VPY8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Colca2F8VPY8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Colca2F8VPY8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Colca2F8VPY8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Colca2F8VPY8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Colca2F8VPY8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Colca2F8VPY8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Colca2F8VPY8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Colca2F8VPY8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Colca2F8VPY8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Colca2F8VPY8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Colca2F8VPY8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Colca2F8VPY8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Colca2F8VPY8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Colca2F8VPY8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Colca2F8VPY8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Colca2F8VPY8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms