Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Gm28038F7BCN9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Gm28038F7BCN9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Gm28038F7BCN9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Gm28038F7BCN9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Gm28038F7BCN9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Gm28038F7BCN9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Gm28038F7BCN9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Gm28038F7BCN9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Gm28038F7BCN9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Gm28038F7BCN9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Gm28038F7BCN9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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