Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms