Protein–RNA interactions for Protein: F6TQW2

Ighg2c, Immunoglobulin heavy constant gamma 2C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighg2cF6TQW2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ighg2cF6TQW2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ighg2cF6TQW2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ighg2cF6TQW2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ighg2cF6TQW2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ighg2cF6TQW2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ighg2cF6TQW2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ighg2cF6TQW2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ighg2cF6TQW2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ighg2cF6TQW2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ighg2cF6TQW2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ighg2cF6TQW2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms