Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Taf4E9QAP7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf4E9QAP7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf4E9QAP7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf4E9QAP7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf4E9QAP7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf4E9QAP7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf4E9QAP7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf4E9QAP7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf4E9QAP7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf4E9QAP7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf4E9QAP7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf4E9QAP7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf4E9QAP7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf4E9QAP7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf4E9QAP7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf4E9QAP7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf4E9QAP7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf4E9QAP7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf4E9QAP7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Taf4E9QAP7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Taf4E9QAP7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Taf4E9QAP7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Taf4E9QAP7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Taf4E9QAP7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Taf4E9QAP7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Taf4E9QAP7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms