Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh16f1E9Q9P8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh16f1E9Q9P8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Rdh16f1E9Q9P8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Rdh16f1E9Q9P8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Rdh16f1E9Q9P8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Rdh16f1E9Q9P8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rdh16f1E9Q9P8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rdh16f1E9Q9P8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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