Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms