Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Urb2E9Q7L1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Urb2E9Q7L1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Urb2E9Q7L1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Urb2E9Q7L1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms