Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E5

Srsf11, Serine/arginine-rich-splicing factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf11E9Q6E5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srsf11E9Q6E5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Srsf11E9Q6E5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Srsf11E9Q6E5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srsf11E9Q6E5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srsf11E9Q6E5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srsf11E9Q6E5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srsf11E9Q6E5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srsf11E9Q6E5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Srsf11E9Q6E5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srsf11E9Q6E5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srsf11E9Q6E5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srsf11E9Q6E5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srsf11E9Q6E5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srsf11E9Q6E5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srsf11E9Q6E5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf11E9Q6E5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf11E9Q6E5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf11E9Q6E5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf11E9Q6E5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf11E9Q6E5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf11E9Q6E5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf11E9Q6E5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf11E9Q6E5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf11E9Q6E5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf11E9Q6E5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf11E9Q6E5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf11E9Q6E5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf11E9Q6E5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf11E9Q6E5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf11E9Q6E5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf11E9Q6E5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf11E9Q6E5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf11E9Q6E5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf11E9Q6E5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf11E9Q6E5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf11E9Q6E5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf11E9Q6E5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf11E9Q6E5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf11E9Q6E5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf11E9Q6E5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf11E9Q6E5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf11E9Q6E5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf11E9Q6E5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf11E9Q6E5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms