Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Pdzd2E9Q1M1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Pdzd2E9Q1M1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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