Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm3095E9Q058 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms