Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms