Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms