Protein–RNA interactions for Protein: E9PVP9

Gm4884, Predicted gene 4884, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4884E9PVP9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4884E9PVP9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4884E9PVP9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4884E9PVP9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4884E9PVP9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4884E9PVP9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4884E9PVP9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4884E9PVP9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4884E9PVP9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4884E9PVP9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4884E9PVP9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4884E9PVP9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4884E9PVP9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4884E9PVP9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4884E9PVP9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4884E9PVP9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4884E9PVP9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4884E9PVP9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4884E9PVP9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4884E9PVP9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4884E9PVP9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4884E9PVP9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4884E9PVP9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4884E9PVP9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4884E9PVP9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4884E9PVP9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4884E9PVP9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4884E9PVP9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4884E9PVP9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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