Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms