Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

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Length 138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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BC035044E0CXF8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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BC035044E0CXF8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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BC035044E0CXF8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC035044E0CXF8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC035044E0CXF8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC035044E0CXF8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC035044E0CXF8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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BC035044E0CXF8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC035044E0CXF8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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BC035044E0CXF8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC035044E0CXF8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC035044E0CXF8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC035044E0CXF8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC035044E0CXF8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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BC035044E0CXF8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC035044E0CXF8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
BC035044E0CXF8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC035044E0CXF8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC035044E0CXF8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC035044E0CXF8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
BC035044E0CXF8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
BC035044E0CXF8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC035044E0CXF8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC035044E0CXF8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC035044E0CXF8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC035044E0CXF8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC035044E0CXF8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC035044E0CXF8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC035044E0CXF8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC035044E0CXF8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC035044E0CXF8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC035044E0CXF8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC035044E0CXF8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC035044E0CXF8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC035044E0CXF8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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BC035044E0CXF8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC035044E0CXF8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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