Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms