Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Rnf217D3YYI7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Rnf217D3YYI7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms