Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rexo5D3YW29 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms