Protein–RNA interactions for Protein: C0HKD9

Mfap1b, Microfibrillar-associated protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfap1bC0HKD9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mfap1bC0HKD9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mfap1bC0HKD9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mfap1bC0HKD9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mfap1bC0HKD9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mfap1bC0HKD9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mfap1bC0HKD9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mfap1bC0HKD9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Mfap1bC0HKD9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mfap1bC0HKD9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mfap1bC0HKD9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mfap1bC0HKD9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mfap1bC0HKD9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mfap1bC0HKD9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mfap1bC0HKD9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mfap1bC0HKD9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Mfap1bC0HKD9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mfap1bC0HKD9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mfap1bC0HKD9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mfap1bC0HKD9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mfap1bC0HKD9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Mfap1bC0HKD9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mfap1bC0HKD9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mfap1bC0HKD9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mfap1bC0HKD9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mfap1bC0HKD9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mfap1bC0HKD9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mfap1bC0HKD9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mfap1bC0HKD9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mfap1bC0HKD9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mfap1bC0HKD9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mfap1bC0HKD9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mfap1bC0HKD9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mfap1bC0HKD9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mfap1bC0HKD9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mfap1bC0HKD9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mfap1bC0HKD9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mfap1bC0HKD9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mfap1bC0HKD9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mfap1bC0HKD9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mfap1bC0HKD9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mfap1bC0HKD9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mfap1bC0HKD9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mfap1bC0HKD9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms