Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC6

Polr3a, DNA-directed RNA polymerase subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3aB2RXC6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr3aB2RXC6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr3aB2RXC6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr3aB2RXC6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Polr3aB2RXC6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Polr3aB2RXC6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Polr3aB2RXC6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Polr3aB2RXC6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Polr3aB2RXC6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Polr3aB2RXC6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Polr3aB2RXC6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr3aB2RXC6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr3aB2RXC6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr3aB2RXC6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr3aB2RXC6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr3aB2RXC6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr3aB2RXC6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr3aB2RXC6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr3aB2RXC6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr3aB2RXC6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr3aB2RXC6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr3aB2RXC6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr3aB2RXC6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr3aB2RXC6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr3aB2RXC6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr3aB2RXC6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr3aB2RXC6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr3aB2RXC6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr3aB2RXC6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr3aB2RXC6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr3aB2RXC6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr3aB2RXC6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr3aB2RXC6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr3aB2RXC6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms