Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms