Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clrn2B2RVW2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clrn2B2RVW2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms