Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms