Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Abcc8B2RUS7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Abcc8B2RUS7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Abcc8B2RUS7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Abcc8B2RUS7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Abcc8B2RUS7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Abcc8B2RUS7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
Abcc8B2RUS7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Abcc8B2RUS7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Abcc8B2RUS7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Abcc8B2RUS7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Abcc8B2RUS7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Abcc8B2RUS7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Abcc8B2RUS7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Abcc8B2RUS7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Abcc8B2RUS7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Abcc8B2RUS7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Abcc8B2RUS7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Abcc8B2RUS7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Abcc8B2RUS7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Abcc8B2RUS7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Abcc8B2RUS7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms