Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ythdc2B2RR83 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ythdc2B2RR83 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ythdc2B2RR83 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ythdc2B2RR83 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ythdc2B2RR83 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ythdc2B2RR83 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ythdc2B2RR83 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ythdc2B2RR83 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ythdc2B2RR83 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ythdc2B2RR83 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ythdc2B2RR83 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ythdc2B2RR83 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ythdc2B2RR83 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ythdc2B2RR83 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ythdc2B2RR83 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ythdc2B2RR83 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ythdc2B2RR83 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ythdc2B2RR83 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Ythdc2B2RR83 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ythdc2B2RR83 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ythdc2B2RR83 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ythdc2B2RR83 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ythdc2B2RR83 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ythdc2B2RR83 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ythdc2B2RR83 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ythdc2B2RR83 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ythdc2B2RR83 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ythdc2B2RR83 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ythdc2B2RR83 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ythdc2B2RR83 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ythdc2B2RR83 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ythdc2B2RR83 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ythdc2B2RR83 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ythdc2B2RR83 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ythdc2B2RR83 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ythdc2B2RR83 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms