Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf3B2RQG2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms