Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms