Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trabd2bB1ATG9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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