Protein–RNA interactions for Protein: B1AT01

1700084M14Rik, RIKEN cDNA 1700084M14 gene, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700084M14RikB1AT01 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700084M14RikB1AT01 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700084M14RikB1AT01 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700084M14RikB1AT01 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700084M14RikB1AT01 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700084M14RikB1AT01 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
1700084M14RikB1AT01 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
1700084M14RikB1AT01 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700084M14RikB1AT01 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700084M14RikB1AT01 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700084M14RikB1AT01 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700084M14RikB1AT01 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700084M14RikB1AT01 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700084M14RikB1AT01 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700084M14RikB1AT01 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700084M14RikB1AT01 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700084M14RikB1AT01 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700084M14RikB1AT01 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
1700084M14RikB1AT01 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700084M14RikB1AT01 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700084M14RikB1AT01 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700084M14RikB1AT01 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700084M14RikB1AT01 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700084M14RikB1AT01 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700084M14RikB1AT01 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700084M14RikB1AT01 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
1700084M14RikB1AT01 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700084M14RikB1AT01 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700084M14RikB1AT01 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700084M14RikB1AT01 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700084M14RikB1AT01 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700084M14RikB1AT01 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700084M14RikB1AT01 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700084M14RikB1AT01 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700084M14RikB1AT01 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms